...然后就停在了待轉區,算闖紅燈還是違章停車會被扣分嗎

不會扣分，是合法操作。

從描述來看，左轉彎進入待轉區突然綠燈變紅燈了，雖然中間沒有黃燈過渡，但是也是在綠燈亮時通過“停止線”的，根據道路交通安全法實施條例中的相關規定，只要能夠在亮紅燈前，車子過了停止線的，就可以繼續通行，不算闖紅燈。

“左轉彎待轉區”是指當同向直行道綠燈亮時，左轉彎車道的車輛必須前移到待轉的區域，等待信號燈變化，才能轉彎。左轉彎的車道增加了數米長的白色虛線框，直接連接到了馬路中間。這些白色虛框線就是設置的“左轉彎待轉區”。

安全通過左轉彎待轉區

1、前方信號燈直行和左轉信號燈紅燈亮時，車輛不得進入“左轉彎待轉區”，需要在停車線外等待，否則就是闖紅燈行為，扣6分。

2、當同向直行信號燈綠燈亮時，左轉彎的車輛進入左轉待轉區，等候放行信號（即使此時左轉彎燈是紅色的）。

3、當左轉彎信號燈綠燈亮時，等候在待轉區的車輛應迅速通過路口。

4、黃燈亮起，還未進入待轉區的車輛，應該停在左轉車道停車線前，不能搶左轉黃燈繼續往待轉區里面擠。